Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMEM114B3SHH9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM114B3SHH9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms