Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCO5BA8MYB1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5BA8MYB1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms