Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NOTOA8MTQ0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms