Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMBP3BA6NNM3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
RIMBP3BA6NNM3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RIMBP3BA6NNM3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RIMBP3BA6NNM3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RIMBP3BA6NNM3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RIMBP3BA6NNM3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RIMBP3BA6NNM3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RIMBP3BA6NNM3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms