Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA8JA6NMD2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GOLGA8JA6NMD2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GOLGA8JA6NMD2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8JA6NMD2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8JA6NMD2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA8JA6NMD2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms