Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C5orf51A6NDU8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C5orf51A6NDU8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C5orf51A6NDU8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C5orf51A6NDU8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C5orf51A6NDU8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C5orf51A6NDU8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C5orf51A6NDU8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C5orf51A6NDU8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C5orf51A6NDU8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C5orf51A6NDU8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C5orf51A6NDU8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C5orf51A6NDU8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C5orf51A6NDU8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms