Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNDIG1LA6NDD5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms