Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR11A4FU01 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR11A4FU01 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR11A4FU01 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR11A4FU01 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR11A4FU01 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR11A4FU01 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTMR11A4FU01 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MTMR11A4FU01 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms