Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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TRBC2A0A5B9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBC2A0A5B9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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TRBC2A0A5B9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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TRBC2A0A5B9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TRBC2A0A5B9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBC2A0A5B9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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