Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC61Q9Y6R9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC61Q9Y6R9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms