Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AUP1Q9Y679 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AUP1Q9Y679 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms