Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms