Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms