Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF5Q9Y2D1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF5Q9Y2D1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms