Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HPSEQ9Y251 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPSEQ9Y251 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms