Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVW-1Q9UQF0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVW-1Q9UQF0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms