Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PADI3Q9ULW8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PADI3Q9ULW8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms