Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DENND2AQ9ULE3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms