Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA2Q9UL42 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA2Q9UL42 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms