Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMFRQ9UKV5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms