Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3Q9UKS6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms