Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ADAM28Q9UKQ2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ADAM28Q9UKQ2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms