Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CHIC2Q9UKJ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms