Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms