Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX4Q9UIU6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX4Q9UIU6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms