Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP25Q9UHP3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP25Q9UHP3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms