Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHORDC1Q9UHD1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHORDC1Q9UHD1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms