Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CFDP1Q9UEE9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CFDP1Q9UEE9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CFDP1Q9UEE9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms