Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MTRRQ9UBK8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms