Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFIP11Q9UBB9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms