Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms