Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MSRB1Q9NZV6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MSRB1Q9NZV6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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