Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MIS18AQ9NYP9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIS18AQ9NYP9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms