Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNK4Q9NYG8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNK4Q9NYG8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms