Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP4R2Q9NY27 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4R2Q9NY27 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms