Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TOR4AQ9NXH8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms