Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CWC25Q9NXE8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms