Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM161AQ9NX61 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM161AQ9NX61 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM161AQ9NX61 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM161AQ9NX61 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM161AQ9NX61 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM161AQ9NX61 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM161AQ9NX61 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM161AQ9NX61 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM161AQ9NX61 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM161AQ9NX61 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM161AQ9NX61 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM161AQ9NX61 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms