Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOPORSQ9NS56 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TOPORSQ9NS56 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms