Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB6BQ9NRW1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms