Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNX15Q9NRS6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms