Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRN4Q9NRL3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
STRN4Q9NRL3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms