Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPTBN5Q9NRC6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTBN5Q9NRC6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms