Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ3

RAVER2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAVER2Q9HCJ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAVER2Q9HCJ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAVER2Q9HCJ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms