Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms