Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB55

CYP3A43, Cytochrome P450 3A43, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A43Q9HB55 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP3A43Q9HB55 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP3A43Q9HB55 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms