Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PRKRIP1Q9H875 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKRIP1Q9H875 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms