Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER2Q9H7U1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER2Q9H7U1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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