Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf33Q9H7E9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf33Q9H7E9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms