Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
XKR8Q9H6D3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
XKR8Q9H6D3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms